本殿は元和２年の建立以来、ほぼ３０～４０年周期で修理が行われていましたが、近年では昭和１２年に屋根葺替が行われて以来、戦後の混乱もあり、荒れるに任せた状態が続いていました。雨漏りとそれに伴う軒廻りの破損は著しく、昭和５７年には屋根に鉄板覆いをかける応急修理が行われました。今回の修理にあたっては、建立当初の流造、流し板葺への復元が可能な資料はありましたが、本殿の延寶・元禄の改造の意匠は本格的で仕事の質もよく、八幡宮全体の社頭を考えた場合、現在の境内に残る他の建物も元禄期で整備され、特に拝殿・幣殿は延寶改造時期にあわせて建てられているため、元禄の改造時の姿に復旧整備することになりました。屋根についても、昭和５７年の鉄板葺を撤去し、元禄・寶暦・天明の各修理時の墨書により、こけら葺としました。